潔凈室的空氣處理系統(tǒng)（通風(fēng)和空調(diào)系統(tǒng)）通常都要應(yīng)用空氣的再循環(huán)，即進入潔凈室的空氣是由經(jīng)過必要處理的室外空氣和取自潔凈室和經(jīng)過二次清潔的循環(huán)空氣組成。
建造潔凈室的最重要原則之一是要做到換氣平衡。即要有足量的室外空氣進入潔凈室，以便補償經(jīng)圍護結(jié)構(gòu)泄漏的空氣，補償出于其它原因的排風(fēng)，以便保證潔凈室內(nèi)有必要的靜壓水平，并符合衛(wèi)生規(guī)范要求。否則由于空氣從周圍環(huán)境滲入潔凈室而不能保證潔凈室的穩(wěn)定工作。
換氣次數(shù)換氣次數(shù)取決于潔凈室1小時內(nèi)換氣循環(huán)次數(shù)，并是IS0 6級~IS0 8級潔凈室的重要特性。美國初期的潔凈室標準就包括換氣次數(shù)的具體建議，這些數(shù)據(jù)也曾被其它規(guī)范標準所引用。
例如，在1997年前，GMP EC就建議B、C和D潔凈區(qū)的最小換氣次數(shù)不得低于20次／／J、時。于1997年實施的GMP EC有關(guān)滅菌藥品生產(chǎn)的附錄中并未列入上述數(shù)據(jù)。在該附錄中僅提出在確定B、C和D潔凈區(qū)的換氣次數(shù)時應(yīng)考慮設(shè)各和人員所在潔凈室的大小。設(shè)計人員的能耐就在于此，以最小的費用得到符合要求潔凈度的潔凈室，這時就以最小的換氣次數(shù)滿足對微氣候參數(shù)的要求，對清潔衛(wèi)生的要求。
在換氣次數(shù)顯著低于20的情況下，現(xiàn)代的潔凈室技術(shù)在許多場合下都能保證必要潔凈度級別。每一工程的具體換氣次數(shù)都各不相同。對空氣處理問題和建造經(jīng)濟有效的潔凈室的。
